Трудовые отношения

В данном случае 3 месяца сррок для обращения в суд со дня когда работник узнал или должен был узнать о нарушении своего права, поскольку речь идет об окончательном расчете, выдачи трудовой книжки...

Ну вы же сами ответили на свой вопрос - только путем обращения в суд с иском о признании трудовых отношений.

Увы, но в данном случае обратная сила закона не работает.
Изменения внесены без оговорок и действуют с момента вступления в силу.

Можете конечно.

Нет. Прямого нарушения закона нет. ваше право работать по основному месту работы и по совместительству.

1. Данные дни не учитываются при начислении заработной платы. заработнная плата начисляется за реально отработанное рабочее время или за дни, которые приравниваются к рабочему времени.
2. Средний заработок для исчисления оплаты по больничному, отпускных и так далее определяется на основании ранее начисленной заработной платы.

Наниматель может отказать в любом случае. Расторжение по данной причине оценочная категория....
Возможно, что придется отстаивать свою точку зрения в суде.

Не совсем верно - уважительность причин о невозможности исполнения трудовых обязанностей оценивает или наниматель, или суд.
Соответственно, все зависит от нюансов и доказательств

Прямо вот так "за больничные" уволить не может. Однако, как вы правильно сами отметили, будет недоволен сотрудником.
Прямого оответа на вопрос "что делать?" в данной ситуации у нас нет

Исходя из описанной ситуации можно сказать что нарушений не усматривается, поскольку прямой ликвидации вашего первоначального предприятия не усматривается.

Контракт не может расторгаться "по собственному желанию работника"!
В данном случае речь идет о ст. 41 ТК - невозможность исполнять трудовые обязанности в связи с переменой места жительства.
расторгается по требованию работника или в судебном порядке

Если работник и наниматель договорились то конечно можно без всякого суда решить вопрос

Если супруг самозанятый, то собственно понятие "декретный отпуск" (правильно - "отпуск по уходу за ребенком до 3 лет) к вашему супругу НЕ МОЖЕТ БЫТЬ ПРИМЕНЕНО.
В принципе "Отпуск" это для лиц, работающих по найму.
Обратитесь в отдел соцобеспечения для подробных разьяснений

В отношении рабочего времени нет такого понятия.
есть сокращенное рабочее время (ст. 118 ТК), однако режим рабочего времени устанавливается по соглашению с нанимателем

Обращаться в суд с требованием о расторженеии контракта по вине нанимателя.
Ждать рассмотрения заявления вы не обязаны. дата расторжения указывается работником в заявлении.
НО! До решения суда вы обязаны ходить на работу, чтобы не быть уволенным за прогулы.

Досрочное расторжение срочного трудового договора или по соглашению сторон, или в случаях установленных законом.
Увы, все законно. Только конечно такой формулировки как "нет замены" закон не содержит. есть согласие нанимателя или не согласие нанимателя. Если ппо соглашению сторон

Согласно ст. 29 ТК уволится можно в течение испытательного срока предупредив нанимателя за 3 календарных дня, либо в последний день испытательного срока.
Причины объяснять работник не обязан

Если в течение одного года после увольнения работника наниматель обнаружит факты нанесения работником ущерба, то имеет право обратиться с требованием о взыскании стоимости такого ущерба

Да. Имеет право

Формальный повод для оформления бессрочного ТД есть, но именно "требовать" вы не можете.
Все по соглашению сторон. ст. 261(4) ТК