Ну да, можете потерять очередь.
31. Граждане снимаются с учета нуждающихся в улучшении жилищных условий в случаях:
31.2. выезда на место жительства в иной населенный пункт, за исключением случаев, если они состоят на учете нуждающихся в улучшении жилищных условий в государственном органе, другой организации, расположенных в данном населенном пункте, и не прекратили с ними трудовых (служебных) отношений;
Т.е. вас снимут с учета в районе, а в Минске могут не поставить на учет - скажут 5 лет проживите и тогда пожалуйста....