В счет-договоре поставщик не прописал,что обязуется выставить электронную счет- фактуру по НДС, но есть пункт" ,,во всем ,что не...

В данном случае рассуждать категориями "законно" или "незаконно" не получается.
В соответствии с законодательством договор считаетс заключенным, если в договоре оговорены требования, установленные законодательством.
Для договора купли-продажи такие требования минимальны:
продавец-покупатель, наименование товара, цена-стоимость с НДС, количество.
Все остальные положения договора вносятся соглашением сторон, или по требованию одной из сторон.
Соответственно, положение об обязательстве выставить электронную счет-фактуру по ндс с одной стороны является необязательным для договора купли-продажи, но если одна из сторон договора заявила требование внести данный пункт, то его надо внести по желанию этой стороны. 

Если что-то осталось неясным или есть другие вопросы по этой же теме:

• для максимально быстрого решения вопроса, созвонитесь с консультантом и договоритесь о личной консультации;
• или напишите комментарий к ответу с уточняющими вопросами по этой теме. Не создавайте новый вопрос!

Свой отзыв о нашем сайте Вы можете оставить тут. Спасибо за участие.